• Центр специализированной хирургической помощи
• Центр анестезиологии и реанимации
• Центр специализированной офтальмологической помощи
• Вспомогательные лечебно-диагностические подразделения
• Центр детской онкологии и гематологии
• Центр по реабилитации и восстановительному лечению детей с патологией ЦНС
• Приемное отделение
• Педиатрическое отделение
• Пульмонологическое отделение
• Нефрологическое отделение
• Инфекционное отделение (боксированное)
• Стационар дневного пребывания
• Отделение по оказанию платных медицинских услуг и по программам ДМС
• Консультативно-диагностический центр
• Отделение паллиативной медицинской помощи детям
• Психоневрологическое отделение